Introducción: La infertilidad afecta el 15% de parejas en edad fértil. El factor masculino está involucrado en alrededor del 50% de estas parejas, 30% sólo por factor masculino y 20% son causas compartidas Objetivo: Caracterizar con herramientas clínico-genéticas el factor masculino en parejas infértiles. Material y métodos: Se estudiaron 300 hombres que asistieron al centro de reproducción asistida. Se aplicó el método clínico y se realizaron ensayos genéticos (cariotipo en sangre periférica y fragmentación de cromatina espermática (FCE). Se caracterizó la muestra según impresión diagnóstica, edad (<45 y ≥45 años: avanzada edad (AEP)) y resultados de los test realizados. Resultados: De los 300 pacientes, el 41.7% presentó alteraciones seminales y el 32.3% fallas reproductivas, de ellos 35.2%  tuvo oligoastenospermias,  28.8% astenospermias y 20.8% azospermias. Del total de la muestra, el 32.3% tuvo FCE patológica y el 12.8% cariotipos positivos,  representando el 19.2% de las azoospermias.  De los pacientes con  FCE  elevada, el 48% tuvo alteraciones seminales, el 41.2% infertilidad idiopática, el 33% alteraciones testiculares y el 16% tenían solamente AEP como factor de riesgo. Sin embargo de los sujetos con 45 años o más, 35.8% tuvo FCE elevados, de ellos 72% con AEP y alteraciones seminales, contrastando con el 29% de los menores de 45 años con FCE elevados (41% con alteraciones seminales). Conclusiones: Estudios posteriores deben evaluar el comportamiento de la edad y su influencia en la calidad seminal en relación con la FCE. Recomendamos la utilización de la FCE en la evaluación de retina en hombres