Introducción: Las enfermedades de almacenamiento lisosomal (EAL) son causadas ​​por mutaciones en genes de enzimas lisosómicas, proteínas de transporte u otros productos génicos esenciales en un sistema lisosomal funcional. La acumulación anormal de sustratos en el lisosoma, conduce a un deterioro celular progresivo y disfunción de numerosos órganos y sistemas. Objetivos: Describir el diagnóstico bioquímico de las EAL en Cuba  en el período 2014-2016.  Métodos: Se realizó un estudio retrospectivo-descriptivo. El universo estuvo constituído por 523 muestras: 170 pacientes con sospecha clínica de estas entidades, 173 controles y 187 familiares. La muestra biológica empleada fue leucocitos procedentes de sangre periférica. Se determinó la concentración de proteínas en el lisado leucocitario mediante  el método de Lowry. La actividad enzimática específica se determinó por métodos fluorimétricos ó espectrofotométricos.  Como criterio diagnóstico se empleó la actividad enzimática relativa al control sano, considerándose  positivo un valor inferior al 30%, la actividad relativa de los padres con resultados entre 45 y 70% y la actividad relativa de otras enzimas lisosomales por encima del 50%. Resultados: Se diagnosticaron 11 pacientes del sexo femenino (52%) y 10 (48%) del sexo masculino, distribuidos en 48% del Oriente, 33 % de Occidente y 19 % del Centro del país. Las enfermedades diagnosticadas fueron: MPS (8), Pompe (3), Esfingolipidosis (7), Oligosacaridosis (3). Se obtuvo un 13% de positividad.  Conclusiones. El porciento de positividad alcanzado en este periodo fue similar al obtenido en el país en años anteriores pero muy inferior al reportado por otros laboratorios a nivel internacional.