Introducción: El Síndrome de Leigh es una encefalopatía debida a defectos en enzimas del metabolismo energético mitocondrial. Entre el 10-20% de los pacientes presentan una mutación T8993G/C en el gen MTATP6, que codifica para la ATPasa 6. Otro 10-20% presenta mutaciones en otros genes mitocondriales. Objetivo: Detectar las mutaciones T8993G/C y otros cambios de nucleótidos en pacientes con Síndrome de Leigh. Métodos: Se estudiaron las mutaciones T8993G/C de dos hermanas con Síndrome de Leigh mediante PCR-RFLP, a partir de ADN leucocitario. Adicionalmente se secuenció la región amplificada (mt.8254-9211). Resultados: Ambas pacientes resultaron negativas para T8993G/C. Por secuenciación de ADN se encontraron siete polimorfismos: C8468T en el gen MTATP8 y C8655T, A8701G, A8784G, A8860G, T8877C y A9072G en el gen MTATP6. También fueron hallados tres cambios no reportados, en aparente heteroplasmia: A8535G, en el gen MTATP8; C8625A y A8693G en el gen MTATP6. El cambio A8535G introduce un codón de parada prematuro de la traducción de la ATPasa 8. C8625A constituye un cambio sinónimo (Thr>Thr) y A8693G conduce a la sustitución del aminoácido Gln 56 de la ATPasa 6 por Arg (p.Gln56Arg). Conclusiones: Las dos pacientes estudiadas resultaron negativas para las mutaciones comunes T8993G/C y presentaron varios cambios de nucleótido, dos de los cuales pudieran afectar la estructura de la ATPasa 8 y de la ATPasa 6, respectivamente.